GR Yaris telah mendapatkan beberapa peningkatan yang signifikan setelah sekitar lima tahun sejak peluncurannya. Untuk tahun 2025, mobil hot hatch ini kini dilengkapi dengan body kit baru yang terdiri dari enam item, termasuk sayap belakang yang dapat disesuaikan untuk meningkatkan stabilitas dan performa mobil di lintasan balap. Selain itu, pendinginan mesin telah ditingkatkan, dengan tambahan saluran udara di berbagai bagian mobil untuk meningkatkan stabilitas dan mengurangi koefisien drag.
Selain upgrade pada body kit, Toyota juga melakukan perubahan pada transmisi otomatis delapan percepatan untuk meresponsifkan perpindahan gigi lebih baik, terutama saat diaktifkan dalam mode manual Sport. Selain itu, ada peningkatan lain seperti baut yang diperlebar untuk kekakuan yang lebih baik, pembesaran pijakan kaki, dan penyediaan rem parkir vertikal yang lebih luas di seluruh model. Fitur keselamatan seperti Toyota Safety Sense juga kini menjadi standar pada model dasar di Jepang.
Dengan segala peningkatan ini, harga GR Yaris yang telah diperbarui bervariasi mulai dari 3.560.000 yen hingga 5.330.000 yen, tergantung pada trim level dan transmisi yang dipilih. Namun, saat ini belum ada konfirmasi apakah upgrade ini akan tersedia di pasar internasional. Melalui berbagai peningkatan tersebut, Toyota terus berinovasi untuk meningkatkan performa dan pengalaman berkendara dengan GR Yaris, memastikan bahwa mobil ini tetap menjadi pilihan menarik bagi para penggemar hot hatch.